其中影响力最大的就是几年前，他和首都大学数学系主任杨振的‘口水仗’，曾经杨振是邱成文的学生，毕业以后取得了一系列数学研究成就。
在留学归国以后，他成为了中国数学会力推的数学家，凭借对微分几何的研究，还成为了第一个在国际数学家大会上，做长达一小时演讲的国内数学家。
事件发生矛盾双方是邱成文和首都大学数学学院，邱成文公开在学术腐败，学术道德标准，海归学者服务时间等问题，对手大学数学学院公开进行批评，其中直接点名批评的就是杨振。
‘口水仗’开始了。
这件事从开始到结束长达一年时间，最开始是邱正文挑起的，指责杨振的学术能力不强，成名完全是靠学术抄袭，有好多媒体参与其中，后来杨振站出来表示，邱成文之所以这么做，就是不希望首都大学建立国际数学研究中心。
后来事情的影响越来越大，有好多学者站出来支持邱成文，也有好多学者站出来支持杨振和首都大学。就连国外的数学家、媒体，也参与进来，有的是质疑邱成文的人品，比如，邱成文称庞加莱猜想是国内学者先证明的，有的是帮杨振做证明，说杨振的研究并不是抄袭，有的是支持邱成文的观点，认为他说出了别人不敢说的话。
总之事情变得很复杂。
因为邱成文没有杨振学术抄袭的确切证据，而杨振也是国内数学界有名的学者之一，最后事情只能不了了之。
从这件事就能知道，国内学术界对待邱成文的态度是有多复杂了，有好多人对邱成文都没有好感，认为他为人处事太过于自我。对于某些事件的看法太过于片面，也有对邱成文非常支持的人，觉得他敢说真话，是学术界的一股清流。
等等。
不管国内学术界对邱成文的评价再复杂，也无法撼动他在数学界的地位，作为第一菲尔兹奖的华人，邱成文在数学研究领域的影响力是世界级的。
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